Office français de la biodiversité

STAGE - " Analyse spatio-temporelle des communautés biologiques - DCE Normandie " H/F

Référence : 2025/3693
Affectation : Direction régionale Normandie
Résidence administrative : Seulline (14)
Poste à pourvoir le : 01/01/2026

Information générale

Positionnement hiérarchiqueSous l’autorité de l’ingénieur données et de la cheffe de service du SRC

Conditions d’emploi : Stage allant de 5 à 6 mois à pourvoir pour l’obtention master 2 (niveau de diplôme visé)

La direction régionale Normandie de l’OFB comprend :

  • 4 services régionaux (service administratif, service connaissance, service police, service appui aux acteurs et mobilisation des territoires), 
  • Une délégation de façade maritime Manche – Mer du Nord,
  • Une unité spécialisée migrateurs amphihalins,
  • 5 services départementaux.

Elle est implantée sur 13 sites et regroupe une centaine d’agents.

Mission

L’OFB met en œuvre annuellement des protocoles de suivis sur différents compartiments biologiques (poissons, macro-invertébrés, diatomées, macrophytes), dont l’objectif finalisé est la production de bio-indicateurs permettant de suivre l’état écologique des milieux aquatiques et ainsi évaluer l’état des masses d’eau dans le cadre de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) (par exemple sur les bassins Seine Normandie et Loire Bretagne pour la région Normandie). 

Selon les compartiments, de nombreux indicateurs normalisés sont utilisés pour le suivi de l’état écologique des stations et des masses d’eau, dont les calculs font référence à des stations pas ou peu impactées par des pressions. Bien que ces indices fournissent une lecture synthétique et rapide des résultats, ils apparaissent parfois limités dans leur utilisation (i) dès lors qu’ils sont comparés à d’autres indices de biodiversité (classiquement utilisés en écologie), ou (ii) lorsqu’ils sont appliqués à certains contextes piscicoles. Par exemple, les changements de classe de qualité ne traduisent pas toujours de manière cohérente les variations observées au sein des communautés en termes de structure et composition. Il peut également en résulter des tendances contrastées entre compartiments biologiques lorsqu’ils sont comparés entre eux, rendant difficiles les interprétations sur les variations de communautés en réponses aux pressions.

Ainsi ce stage a pour objectif principal l’analyse croisée des tendances spatio-temporelles des communautés biologiques (poissons, macro-invertébrés, diatomées, macrophytes) inventoriées dans le cadre des réseaux de suivis de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) en région Normandie.

Activités principales

Dans le détail, les principales missions consisteront à :

  • Affiner le périmètre de l’étude, c’est à dire rassembler les informations disponibles, choisir un ensemble de stations ayant des données biologiques disponibles sur la période de 2007 à 2024 (parmi les réseaux de stations DCE),
  • Proposer un cadre méthodologique (i.e. choix d’indices, des analyses statistiques, …) pour tester l’existence de tendances spatio-temporelles pour les différents compartiments biologiques (ainsi que le croisement entre eux), et mettre en œuvre les analyses.
  • Confronter les résultats obtenus à la bibliographie scientifique existante, et faire le lien avec les opérateurs terrains sur quelques cas complexes de stations préalablement identifiées,
  • Donner des clefs d’analyses et lectures facilités pour les futures expertises à l’échelle régionale,
  • Selon l’avancée du stage, d’autres éléments et paramètres environnementaux pourront être mobilisés pour les analyses.

L’ensemble des analyses et documents produits durant le stage respectera les principes de reproductibilité et d’ouverture du code comme des données (approche FAIR).

Ce stage s’effectuera au sein du Service Connaissance de la Direction régionale Normandie ; l’encadrement sera assuré par l’ingénieur données et la cheffe du service, et des liens fonctionnels seront mis en place avec l’ingénieure milieux aquatiques et le laboratoire d’hydrobiologie.

Compétences et qualités requises

Connaissances :

  • Statistiques et modélisation,
  • Bonne utilisation du logiciel R,
  • Connaissances générales en écologie, et en écologie aquatique,
  • Utilisation de logiciels de gestion de version et plateforme de dépôts de code (ex : Git, GitHub).

Savoir-être professionnel :

  • Curiosité, ouverture d’esprit,
  • Sens de l’initiative et Capacité d’autonomie, 
  • Rigueur et organisation,
  • Aptitude à la rédaction écrite.

Diplômes – Formation – Expérience :

  • Niveau bac +5 / Master / Ingénieur / Césure,
  • Master avec spécialité en lien avec le stage : biostatistiques, écologie, biodiversité ; avec une bonne pratique des outils informatiques en vue des analyses de données.,
  • Des profils atypiques pourront également être considérés.

Autres :

  • Permis B,
  • Informatique : base en SIG (QGIS) et bureautique (Pack Office),
  • La maitrise de l’anglais technique/scientifique serait un plus.

Conditions d'exercice / sujétions particulières

Poste basé à Seulline (14), travail de bureau à la Direction régionale Normandie de l’OFB ou en télétravail. Déplacements ponctuels possibles (réunions, campagnes prélèvements, …) en région Normandie. 

  • Frais de déplacements pris en charge.
  • Début de stage envisagé : (date de début flexible selon profil).

Dépôt de candidature (en interne)

Pour déposer une candidature, les documents suivants vous seront demandés :

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