Positionnement hiérarchique : Sous l’autorité de la coordinatrice du projet FEXTE, et supervisé par Myriam Heuertz, David Soulema (Biogeco, INRAE Université de Bordeaux); Jessica Da Silva (SANBI, South Africa), un représentant de la LPO France
Intitulé complet de l'offre de stage : Calcul des indicateurs génétiques chez les espèces d'oiseaux de France et d'Afrique du Sud : contributions au rapport présenté à la Convention sur la diversité biologique H/F
Conditions d’emploi : Stage de 6 mois à pourvoir pour l’obtention BAC + 5 (niveau de diplôme visé)
L’Office français de la biodiversité (OFB), établissement public placé sous la tutelle des ministres chargés de l’Environnement et de l’Agriculture, a été créé le 1er janvier 2020 par la loi n° 2019-773 du 24 juillet 2019, pour protéger et restaurer la biodiversité.
Conformément à l’article L.131-9 du code de l’environnement, il « contribue, s'agissant des milieux terrestres, aquatiques et marins, à la surveillance, la préservation, la gestion et la restauration de la biodiversité ainsi qu'à la gestion équilibrée et durable de l'eau en coordination avec la politique nationale de lutte contre le réchauffement climatique », grâce au continuum de ses trois grandes missions complémentaires : « Connaître », « Accompagner », « Protéger ».
Pour remplir ses missions, l’OFB compte plus de 3 000 agents, dont plus des deux-tiers agissent sur le terrain dans l’Hexagone et dans les Outre-mer. Il s’appuie sur des équipes pluridisciplinaires : inspecteurs de l’environnement, ingénieurs, experts, spécialistes, vétérinaires, techniciens, personnels scientifiques, techniques et administratifs…
L’établissement est organisé de façon matricielle pour prendre en compte tous les milieux, en transversalité, selon une articulation à trois niveaux :
Doté d’un budget de plus de 600 M€, l’établissement dispose un Contrat d’objectifs et de performance pour la période 2026-2030 signé par les ministres le 12 décembre 2025, et d’un programme d’intervention pour la période 2026-2030, approuvé lors du Conseil d’administration du 12 mars 2026, qui s’inscrivent notamment dans le cadre des différents plans et stratégies dont s’est dotée la France (stratégie nationale pour la biodiversité, stratégie nationale pour les aires protégées, plan Eau dans les Outre-mer, stratégie nationale bas carbone, plan national d’adaptation au changement climatique, stratégie nationale pour la mer et le littoral, stratégie Ecophyto, plan national santé environnement, etc.) ou du nouveau règlement européen sur la restauration de la nature.
Direction/service/unité
Directement rattachée au Directeur Général, la Direction des relations européennes et internationales (DREI) a les missions suivantes :
- Le renforcement de la présence française en Europe et à l’International, le développement de partenariats, l’inscription dans les réseaux et initiatives structurantes ;
- L’appui aux services de l’État pour la négociation et la mise en œuvre des conventions transfrontalières, régionales et internationales, ainsi que pour l’évaluation de la contribution de la France à ces conventions ;
- L’appui aux services de l’État pour le développement, la négociation, la mise en œuvre et l’évaluation des politiques et directives européennes dans le domaine de la biodiversité ;
- Le développement de projets et renforcement de capacités pour la coopération européenne et internationale.
Ces missions s’appuient sur la mobilisation d’une expertise interne et externe à l’OFB.
Partenariat à l’international avec l’Afrique du Sud
L’UMR Biogeco (INRAE, Université de Bordeaux), l’OFB et le SANBI collaborent au sein du projet FEXTE afin de faciliter la mise en œuvre du Cadre Mondial pour la Biodiversité (CMB) de la Convention sur la Diversité Biologique (CDB) en France et en Afrique du Sud, en ce qui concerne l’objectif A et la cible 4 relatifs à la protection et à la restauration des espèces et de leur diversité génétique. La France et l’Afrique du Sud sont toutes deux Parties à la CDB et s’engagent donc à rendre compte périodiquement de leurs progrès vers la réalisation des objectifs et cibles du CMB, le prochain rapport étant prévu pour 2029. Ce stage porte sur deux indicateurs génétiques adoptés dans le CMB, A.4 ou Ne500 – la proportion des populations dont la taille efficace est supérieure à 500 – et A.CY.22 ou PM – la proportion de populations maintenues. Les deux pays ont calculé ces indicateurs sur un échantillon représentatif d’espèces dans le cadre d’une étude pilote (Mastretta-Yanes et al. 2024a), dont les données ont été présentées dans le 7e rapport national de chaque pays à la CDB (février 2026).
Ce stage s’appuiera sur les méthodes du cadre de suivi de la CDB (Mastretta-Yanes et al. 2024b) pour calculer ces indicateurs génétiques sur un échantillon représentatif d’espèces d’oiseaux des deux pays. La sélection des espèces s’appuiera sur des critères communs, tels que le type d’habitat occupé ou le rôle fonctionnel, afin d’obtenir un ensemble de données permettant une comparaison entre les pays. Plus précisément, des données génétiques ou des données indirectes non génétiques, telles que les observations de nidification, seront compilées pour les espèces sélectionnées, la disponibilité des données déterminant la méthode la plus appropriée pour le calcul des indicateurs (Mastretta-Yanes et al. 2024b, Harribey et al. 2026, Mouton et al. 2026). Ce projet de stage s’inscrira dans le cadre du projet français FR-IDGE, un projet collaboratif OFB-INRAE portant sur la mise en œuvre d’indicateurs génétiques sur les territoires français. L’encadrement conjoint du stagiaire par l’ensemble des superviseurs s’appuiera sur des réunions en ligne régulières, en complément de l’encadrement sur place à Biogeco. La collaboration dans le cadre de ce stage apportera des avantages mutuels à la LPO, à Biogeco (INRAE, Université de Bordeaux), à l’OFB et au SANBI grâce à l’échange réciproque d’expertise, de flux de données et d’approches analytiques, renforçant ainsi la capacité de ces institutions à mettre en œuvre, affiner et faire progresser les évaluations de la diversité génétique dans le cadre du suivi de la CDB, tout en contribuant à la mise en œuvre d’indicateurs génétiques dans la gestion de la conservation.
Relations internes :
Le/la stagiaire est rattachée à la DREI et sous l’autorité de la coordinatrice du projet FEXTE.
Relations externes :
Le/la stagiaire est supervisé par Myriam Heuertz et David Soulema (Biogeco), en collaboration avec Jessica da Silva (SANBI), un représentant de la LPO France, et avec un appui de leurs collègues respectifs. Concernant la compilation des données et la mise en œuvre du flux de travail, le/la stagiaire sera en lien avec une unité spécifique de Patrinat (Arzhvaël Jeusset, Claire Régnier, Fanny Lepareur, OFB-MNHN), le Pôle National des Données de Biodiversité (Yvan Le Bras, MNHN), et le GBIF France (Anne-Sophie Archambeau, IRD) pour la France, ainsi qu’avec les collaborateurs concernés et les réseaux de données sur la biodiversité en Afrique du Sud.
Connaissances :
Bonne connaissance des concepts de base en écologie et biologie de l’évolution et des enjeux environnementaux mondiaux. Maîtrise en gestion de base de données et en programmation de base. Aisance en veille / recherche de données (littérature, bases de données, rapports…).
Savoir-faire opérationnel :
Savoir-être professionnel :
Diplômes – Formation – Expérience :
Étudiant.e en cursus de Master (idéalement Master2) en biologie, écologie, évolution, bio-informatique ou similaire ou étudiant.e/élève ingénieur en période de césure.
Possibilité de déplacement en France.
Pour déposer une candidature, les documents suivants vous seront demandés :
