Office français de la biodiversité

CDD - Chargé(e) de mission "R&D observation des poissons récifaux" H/F

Référence : 2025/3750
Affectation : Direction surveillance, évaluation, données
Catégorie : A
Résidence administrative : Dinard (35)
Poste à pourvoir le : 01/01/2026
Date limite de candidature : 16/11/2025

Information générale

Positionnement hiérarchique : Sous l’autorité du chef d’équipe Milieux Marins - PatriNat

Conditions d’emploi : Emploi non permanent de 12 mois à pourvoir soit par un contractuel en contrat de projet* (rémunération selon expérience professionnelle comprise entre 2 999 € et 3 134  € bruts mensuels), soit par un fonctionnaire en détachement sur contrat

* Article L332-24 du code de la fonction publique

Créé le 1er janvier 2020, l’Office français de la biodiversité (OFB) est un établissement public administratif dédié à la sauvegarde de la biodiversité sous la tutelle des ministres chargés de l’environnement et de l’agriculture. Doté d’un budget de plus de 600 millions d’euros (budget initial 2024), il s’appuie sur l’expertise de plus de 3 000 agents, dont une grande partie agit sur le terrain avec, notamment, 1 700 inspecteurs de l’environnement. 

L’établissement est au cœur de l’action pour la préservation du vivant dans les milieux aquatiques, terrestres et marins, tant en métropole que dans les Outre-mer. Les équipes interviennent chaque jour pour lutter contre l’érosion de la biodiversité face aux pressions exercées par la destruction et la fragmentation des milieux naturels, les multiples pollutions, la surexploitation des ressources naturelles, les conséquences du changement climatique, l’introduction d’espèces exotiques envahissantes.

 A ce titre, l’OFB est responsable de 5 missions complémentaires :

  • la police de l’environnement et la police sanitaire de la faune sauvage
  • la connaissance, la recherche et l’expertise sur les espèces, les milieux et leurs usages
  • l’appui à la mise en œuvre des politiques publiques
  • la gestion et l’appui aux gestionnaires d’espaces naturels
  • l’appui aux acteurs et la mobilisation de la société

Le Partenariat Biodiversa + :
L’OFB est engagé dans un partenariat européen Biodiversa+ suite à un appel d’offres de la Commission européenne en 2021 ("European partnership rescuing biodiversity to safeguard life on Earth"). Ce partenariat est financé par le programme cadre Horizon Europe HORIZON-CL6-2021-BIODIV-02-01. Il rassemble 75 partenaires de 37 pays principalement européens. La coordination est assurée par la Politique scientifique fédérale (BELSPO) en Belgique et la Fondation pour la Recherche Scientifique (FRB) en France. L’OFB est engagé dans le partenariat sur le package 2 « Promouvoir et soutenir la surveillance transnationale de la biodiversité » et a la responsabilité de la tâche 2.1 « Définir des priorités partagées, une couverture adéquate et des indicateurs pour la surveillance de la biodiversité pour mieux correspondre aux besoins de recherche, de la société et des politiques publiques », de la sous-tâche 2.1.1 « Préciser les priorités et besoins pour un couverture adéquate de la surveillance pour mieux correspondre aux besoins de recherche, de la société et des politiques publiques », et de la sous-tâche 2.2.1 « Harmoniser les protocoles opérationnels et les méthodes d’inventaires entres les régions et les pays ».

Le projet EuRockFish :
Dans ce cadre, l’OFB coordonne une étude pilote lancée en 2024 par Biodiversa+ sur la standardisation des méthodes de surveillance des peuplements de poissons associés aux milieux côtiers rocheux. Cette étude engage 6 partenaires actifs à travers l’Europe et au-delà (Norvège, Danemark, France, Espagne, Turquie et Israël). Elle vise à évaluer la complémentarité de trois méthodes (les comptages visuels en plongée, la stéréo-vidéo appâtée et le metabarcoding d’ADNe) afin de standardiser/harmoniser la surveillance et l’évaluation de l’état écologique de ces peuplements de poissons, pour répondre aux besoins de connaissance, de surveillance et d’évaluation, en lien avec les différentes politiques publiques (DCSMM, OSPAR, etc.). Le projet se déroulera en deux temps : une première année dédiée à la préparation et la collecte des données in-situ (par chacun des partenaires) et une deuxième année dédiée à l’analyse des données, leur valorisation et au rapportage, incluant la rédaction d’un guide méthodologique pour la surveillance des poissons côtiers rocheux d’Europe et zone adjacente. Tout cela contribue à structurer un réseau d’Observation pan-Européen.

PatriNat :
Au sein de l’OFB, le travail scientifique et technique relevant du projet EuRockFish est confié à l’unité d’Appui et de Recherche PatriNat (conjointe entre OFB, MNHN, CNRS et IRD), qui est un centre d’expertise scientifique sur la biodiversité et la géodiversité de la France métropolitaine et ultramarine. Concernant l’expertise sur les poissons côtiers rocheux, la cellule « poissons côtiers et espèces patrimoniales » de PatriNat apporte un appui scientifique au développement et à la mise en œuvre de la surveillance et l’évaluation des poissons côtiers dans le cadre de la DCSMM. Le projet EuRockFish s’articule donc avec ces missions connexes faisant l’objets de nombreux travaux tout au long du continuum recherche-expertise, pilotés en propre ou en collaboration avec des unités et laboratoires de recherche.

Mission

Au sein de la cellule « poissons côtiers et espèces patrimoniales » de PatriNat, hébergée à la station Marine de Dinard du MNHN, la personne titulaire sera responsable de deux grandes missions :


1)    Gestion du projet EuRockFish : Coordination scientifique et technique du partenariat EuRockFish et Reporting
2)    Ecologie numérique : Gestion, bancarisation, publication, analyse et valorisation des données UVC, caméra appâtée et eDNA collectées par l’OFB et les autres partenaires du programme Eurockfish, et par PatriNat dans le cadre de ses projets connexes.

Activités principales

Gestion du projet EuRockFish :

  • Instruire et animer une réflexion collective sur l’harmonisation des protocoles de suivis des peuplements de poissons associés aux milieux côtiers rocheux, à l’échelle européenne
  • Veiller à la cohérence entre les développements EUROCKFISH et les travaux portés par PATRINAT dans le cadre de la cellule (DCSMM, OSPAR, etc.).
  • Assurer la rédaction des livrables scientifiques EuRockfish 
  • Prospecter / chercher à financer la suite du projet EuRockFish, en vue de pérenniser un réseau d’Observation pour les poissons côtiers rocheux.

Ecologie numérique :
•    Gestion des données :

  • Centraliser toutes les données d’occurrences/abondances/biomasses collectées par PatriNat et le partenariat Eurockfish via les différentes méthodes. Consolider les données et métadonnées en lien avec les partenaires.
  • Bancariser et diffuser les données (GBIF/SINP/…)

•    Analyses biostatistiques des données :

  • Tester les complémentarités des différentes méthodes d’échantillonnages pour étudier les peuplements de poissons
  • Consolider les protocoles. Optimiser l’effort d’échantillonnage avec une analyse cout/bénéfice  pour l’observation à l’échelle site voire façade nationale

•    Valorisation des analyses, par des communications écrites et orales (dont rédaction d’articles scientifiques)

Autres activités :

  • Si nécessaire/besoin, participation aux missions de terrains de la cellule Poissons Côtiers

Livrables :

  • « Data Management Plan » du projet EuRockFish
  • Données bancarisées GBIF/SINP ou Seanoe
  • Datapaper (si accord des différents partenaires du projet) 
  • Scripts Rstudio annotés permettant de renouveler aisément les travaux de bancarisation et analyses
  • Rapport d’analyse et interprétation écologique, par exemple sous la forme d’un article dans journal à comité de lecture
  • Guide méthodologique pour une surveillance standardisée des peuplements de poissons associés aux milieux rocheux avec description des protocoles recommandés
  • Rapport final de l’étude pilote EuRockFish 

 

Relations liées au poste

Relations internes :

  • Membres de la cellule poissons côtiers de PatriNat
  • Equipe « Expertise en écologie marine » et autres équipes de PatriNat /Biodiversa+
  • Référents scientifiques nationaux pour les poissons côtiers
  • Services de la direction de la Surveillance, de l’Évaluation et des Données (DSUED)

Relations externes :

  • Ministère de l’Environnement du Danemark 
  • Partenaires européens impliqués dans l’étude pilote Biodiversa+ 
  • Projets BiodivMon
  • Consortium Marco-BOLO

Profil recherché

 

 Diplôme souhaité de niveau BAC +8 en écologie et/ou biostatistiques

Compétences et qualités requises

Connaissances :

  • Connaissances dans la structuration de jeux de données croisant traits x espèces x environnement
  • Connaissance en théorie de l’échantillonnage et écologie des communautés
  • Méthodes avancées en analyses uni- et multivariées des données traits x espèces x environnement
  • Connaissances dans le formatage de données au format SINP et fonctionnement de l’INPN
  • Connaissances sur le fonctionnement des communautés des poissons récifaux
  • Connaissances des principes FAIR

Savoir-faire opérationnel :

  • Savoir Utiliser des logiciel de biostatistiques Rstudio, ainsi que de Rmarkdown et GitHub
  •  Maîtriser les outils bureautique suite MS Office, dont maitrise des fonctionnalités avancées de MS Word et MS Excel.
  • Avoir une bonne capacité de rédaction scientifique en français comme en anglais
  • Savoir rédiger des métadonnées, utiliser les référentiels, bancariser les données (dont format SINP et Darwin Core) 

Savoir-être professionnel :

  • Être capable de travailler en autonomie sur ordinateur 

Conditions d'exercice / sujétions particulières

La/le titulaire du poste sera affecté(e) à la DSUED, unité PatriNat, équipe Expertise en écologie marine, Cellule Poissons Côtiers. Elle/il sera hébergé(e) au sein de la station marine de Dinard du MNHN.
Elle/il sera sous l’autorité hiérarchique du chef de l’équipe expertise en écologie marine et sous l’autorité fonctionnelle du Référent Ecologie des poissons récifaux. Elle/il devra par ailleurs respecter les règles d’accueil dictées par le chef de la station marine de Dinard.

Dépôt de candidature

Pour déposer une candidature, les documents suivants vous seront demandés :

  • CV
  • Lettre de motivation
  • Pour les fonctionnaires uniquement : dernier arrêté de situation administrative
  • Pour les non titulaires : diplôme le plus élevé obtenu

Nous rejoindre, c'est aussi

Rejoindre l’Office français de la biodiversité, c’est aussi bénéficier de nombreux avantages vous garantissant des conditions optimales pour accomplir vos missions :

  • Protection sociale complémentaire obligatoire (sauf cas de dispense), avec participation de l’Office français de la biodiversité de 50% en moyenne.
  • Prise en charge des frais de transport en commun à hauteur de 75% dans la limite de 99 € par mois.
  • Forfait mobilité durable pour les trajets domicile-travail en vélo ou en covoiturage cumulable avec la prise en charge des frais de transports en commun.
  • Association des personnels proposant des activités sociales, culturelles, sportives et de loisirs, achats groupés (chocolat, produits artisanaux, etc.) à des tarifs attractifs. 
  • Indemnité forfaitaire de télétravail : 2,88 € par jour de télétravail dans la limite de 253,44 € par an.
  • Association des personnels proposant des activités sociales, culturelles, sportives et de loisirs, achats groupés (chocolat, produits artisanaux, etc.) à des tarifs attractifs. (NB : 3 mois d’ancienneté requise pour les contractuels). 
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